里见孝太郎是一名普通的高中一年级学生，因为房租便宜，他搬进了一间只有三坪大小、月租五千日元的破旧公寓106号房。然而从入住的第一天起，这座狭小的房间便再无宁日：来自地底的少女仓野菊理宣称这里是祖先传承的土地，幽灵少女东本愿早苗紧随其后，声称这是自己住了多年的家，宇宙神圣佛德赛帝国的公主提亚米莉丝驾着飞船降临，笨手笨脚的魔法少女虹野由莉佳也神秘现身。围绕小小的三坪房间，形形色色的“侵略者”轮番登场，与孝太郎展开了一场场啼笑皆非的攻防战。

　　这部作品表面上是轻松爆笑的日常喜剧，内里却埋藏着一条跨越时空的宏大主线。孝太郎与少女们在打打闹闹中逐渐敞开心扉，成为彼此不可或缺的伙伴，而他偶然参与的一场角色扮演游戏，竟与遥远的星际历史有着千丝万缕的联系，青春、友情、爱恋与命运的羁绊，在狭小的房间里悄然交织升华。

　　本作由健速创作、Poco负责插画，凭借密集的笑料、鲜明的角色群像与意想不到的剧情展开广受好评，后被改编为电视动画等多种形式。房间虽小，承载的却是一段温暖而壮阔的青春物语，这正是“三坪房间的侵略者”最打动人心之处。