医学数据挖掘精品课程-GEO、TCGA、Oncomine数据库

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医学数据挖掘精品课程 -GEO、TCGA、Oncomine 数据库

课程简介

本系列课程将以视频的方式跟大家一起交流数据挖掘的神奇之处,用 R 软件和 perl 带大家玩转基因数据,从最简单的数据下载到最后我们绘制一张 5 年生存率,这桌饕餮盛宴,一定符合大家的口味。

目前市面上较少有系统的数据挖掘方面的视频,很多资料也是零零散散,我们将其进行整理,按照挖掘的一般流程跟大家进行讲解,整个思路将会非常清晰。

现在分析基因数据的软件非常多,有些有文献支持,有些有点山寨、对于很多初学者其实非常不容易选择。我们不仅会在第二讲中会讲 GEO 的一些在线工具,更多地我们选择目前最常用,也是最经典的两种编程软件,R 和 PERL 跟大家进行讲解。这两种软件也是目前功能非常最为强大的编程工具,几乎可以解决数据挖掘方面的绝大部分操作。其中用 R 软件做出的可视化效果非常好,不是一般普通软件可以替代,而且可以进行不断加工和优化。其次,编程的代码已经帮大家整理好,大家并不需要担心自己不会编程,只要照着视频做,一般不会有太大问题。

现在数据库有很多,我们这次课程主要选择了 GEO 和 TCGA,分别是当前最全面的数据库和最大的肿瘤数据库,掌握这两个数据库,可以帮助大家解决科研方面很多问题。

最后一点,我们此次的教学目的很简单,不提倡走马观花地学习各种数据库,而是踏踏实实将这两个重要的数据库的操作讲解给大家听。我们保证这套视频都是实实在在的干货,只讲学员最为关心的内容,不会穿插与课程不相关的内容。

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资源蛙
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